Основное оборудование — генераторы и гидротурбины — было приобретено в Швеции и Финляндии. В годы войны сооружения Кондопожской ГЭС подверглись значительному разрушению, однако еще до окончания военных действий станцию начали восстанавливать.
19 декабря 1947 г. был пущен агрегат № 1, а 29 марта 1951 г. — третий агрегат. Полное восстановление станции закончилось в марте 1951 г. с пуском третьего генератора мощностью 4,2 МВт.